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Facturación electrónica para médicos y clínicas en Guatemala

Publicado el 14 de mayo de 2026

Facturación electrónica para médicos y clínicas en Guatemala

Si sos médico, dentista, psicólogo, fisioterapeuta o tenés una clínica en Guatemala, la facturación electrónica es obligatoria para vos. Y aunque tu especialidad es la salud, no la contabilidad, facturar no tiene que ser complicado.

La realidad del médico emprendedor

Muchos profesionales de la salud en Guatemala:

  • Atienden en consultorio privado
  • Trabajan en hospital Y tienen consulta privada
  • Atienden emergencias a cualquier hora
  • No tienen personal administrativo
  • Odian la parte administrativa del negocio

La facturación suele quedar de último en la lista de prioridades. Pero es una obligación que no podés ignorar.

Qué debés facturar

Como profesional de salud, debés emitir factura por:

  • Consultas médicas — cada consulta que cobrás
  • Procedimientos — cirugías menores, exámenes, tratamientos
  • Estudios y laboratorios — si cobrás directamente
  • Medicamentos — si vendés medicamentos en tu consultorio
  • Cualquier servicio cobrado — terapias, seguimiento, etc.

Facturación de consultas médicas

Consulta regular

“Facturar Q400 a Ana Hernández NIT 5678901 por consulta médica general”

Consulta a consumidor final

Si tu paciente no te da NIT:

“Facturar Q400 a CF por consulta médica”

Procedimiento

“Facturar Q2,500 a Roberto Pérez NIT 3456789 por procedimiento de endoscopia digestiva”

Paquete de tratamiento

“Facturar Q5,000 a María García NIT 8765432 por tratamiento de ortodoncia — mensualidad 3/12”

Situaciones especiales en salud

Seguros médicos

Si atendés pacientes con seguro médico, el flujo puede variar:

  • Si el paciente paga directo y el seguro le reembolsa → le facturás al paciente
  • Si la aseguradora te paga directamente → le facturás a la aseguradora

Consultá con cada aseguradora sobre su proceso de facturación.

IGSS y establecimientos públicos

Si trabajás para el IGSS o establecimientos públicos, generalmente ellos se encargan de la facturación institucional. Pero tus ingresos por consulta privada sí los facturás vos.

Emergencias y consultas fuera de horario

No importa la hora — si cobrás, facturás. Con FEL Simple podés facturar a las 3 de la mañana si es necesario.

Para clínicas con personal

Si tenés una clínica con recepcionista o personal administrativo:

La recepcionista puede facturar

Configurá a tu recepcionista como usuario de FEL Simple. Ella puede emitir facturas al momento de cobrar, sin que vos tengás que intervenir.

Flujo en clínica

  1. Paciente termina consulta
  2. Pasa a recepción/caja
  3. La recepcionista cobra y pregunta por NIT
  4. Emite factura desde WhatsApp
  5. Le da el PDF al paciente (impreso o por WhatsApp)

Múltiples médicos en la clínica

Si la clínica tiene varios médicos, cada uno puede tener su propio NIT o todos pueden facturar bajo el NIT de la clínica. Depende de cómo esté estructurado el negocio.

Descripciones recomendadas

Para facturas de servicios médicos:

  • “Consulta médica general”
  • “Consulta de especialidad — [especialidad]”
  • “Evaluación y diagnóstico”
  • “Procedimiento médico — [nombre del procedimiento]”
  • “Tratamiento de [condición general]”
  • “Estudios de laboratorio”
  • “Consulta de seguimiento”

Nota: No es necesario detallar el diagnóstico del paciente en la factura. “Consulta médica” es suficiente. La privacidad del paciente es importante.

Régimen fiscal para médicos

Pequeño contribuyente

Si tus honorarios anuales no superan Q465,381.25 (~Q38,000/mes):

  • 5% sobre ingresos brutos
  • Simple y directo
  • Ideal para médicos con consultorio pequeño

Régimen sobre utilidades

Si tenés una clínica con gastos significativos (alquiler, equipo médico, personal):

  • ISR sobre utilidades (ingresos - gastos)
  • Podés deducir gastos de la clínica
  • Requiere contabilidad formal

Consultá con tu contador para decidir.

Preguntas frecuentes

¿Puedo facturar una consulta de Q100?

Sí. Toda consulta cobrada, sin importar el monto, necesita factura.

¿Mis pacientes de IGSS necesitan factura?

No, los servicios prestados a través del IGSS no generan facturación directa tuya al paciente. Solo tus consultas privadas.

¿Cómo manejo las citas canceladas con cargo?

Si cobrás por citas canceladas, emitís factura por ese cargo. “Cargo por cita cancelada” es una descripción válida.

¿Necesito facturar si mi paciente paga con tarjeta?

Sí. La forma de pago no cambia la obligación de facturar. Sea efectivo, tarjeta, transferencia o cualquier otro método.

¿FEL Simple es HIPAA compliant?

FEL Simple no almacena información clínica del paciente. Las facturas contienen datos fiscales, no médicos. La privacidad médica se mantiene.

¿Puedo imprimir la factura para darla en el consultorio?

Sí. Podés imprimir el PDF que FEL Simple te envía.

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